Tvorba mesta Tomsk sa začala v roku 1604 výstavbou pevnosti neďaleko rieky Tom. Samotný Boris Godunov požehnal výstavbu nového mesta a na počesť poslal obraz Najsvätejšej Trojice. V centre budúceho mesta Tomsk sa začala výstavba nového kostola. A od tohto momentu začína rásť a rozvíjať sa pravoslávny život mešťanov. V Tomsku sa stavajú početné chrámy, kaplnky a kostoly.
Kostol Najsvätejšej Trojice
Už viac ako 150 rokov stojí na vrchu Voskresenskaya zasvätená budova kostola Najsvätejšej Trojice. Bol postavený a osvetlený v roku 1844.
V ťažkých štyridsiatych rokoch minulého storočia sa zadné kostoly odovzdávali z rúk do rúk. Najprv tam bola v roku 1939 garáž a o niečo neskôr pekáreň miestnej pekárne. Po skončení vojny, v roku 1945, bol chrám vrátený veriacim a vo februári 1946 bol kostol znovu vysvätený. Reštaurátorské práce v kostole Najsvätejšej Trojice v Tomsku boli vykonané na náklady farníkov. Kostol funguje dodnes, fungujeNedeľná škola a knižnica.
Kostol vzkriesenia
Medzi kostolmi v Tomsku je tento jeden z najstarších. Je prakticky v rovnakom veku ako mesto. Pôvodne bol na území kláštora v roku 1644 postavený drevený kostol. V roku 1789 bol položený základ nového dvojposchodového kostola. Po dokončení výstavby novej budovy bol starý drevený kostol podľa pravoslávneho zvyku spálený a rozptýlený do vetra. Ako mnohé kostoly v Tomsku, v druhej polovici 30-tych rokov minulého storočia bol chrám zatvorený a až v roku 1995 bol znovu vysvätený a pravoslávni veriaci mohli opäť navštevovať bohoslužby.
Znamensky kostol
Kostol je pomenovaný podľa ikony Matky Božej „Znamenie“. Spočiatku to bol jednoduchý drevený chrám postavený v 17. storočí. Stavba kamenného chrámu začala v roku 1784 na náklady šľachty Kachalovcov, potomkov Ivana Kachalova, ktorý je považovaný za zakladateľa kostola. V roku 1935 bol kostol zničený a prestavaný až v roku 1992 na náklady farníkov.
Kostol Petra a Pavla
Na jednom z kopcov klesajúcich do záplavovej oblasti rieky Ushaika, ktorú miestni poznajú ako Mukhin Hillock, býval kríž a kaplnka. Neskôr na tomto mieste postavili Katedrálu Petra a Pavla. Kostol bol vysvätený v roku 1911. V roku 1938 boli bohoslužby zastavené a na území kostola sa nachádzal sklad liehovaru. Ale už v roku 1945 sa cirkev vrátila do zaužívaného režimu. Kostol Petra a Pavla je jedným z mála kostolov v Tomsku, ktorý naďalej prijímal farníkov v období 50-90 rokovrokov XX storočia.
Domový kostol v mene svätého Mikuláša Divotvorcu
Začiatkom 90. rokov bol na základe psychiatrickej liečebne postavený a osvetlený jeden z kostolov v meste Tomsk, pomenovaný po svätom Mikulášovi Divotvorcovi. Spočiatku bola postavená podľa určitého konceptu, a to interakcie duchovných síl Pána a liečivých prostriedkov medicíny pri pomoci duševne chorým. Ideologická stránka sa však stratila v roku 1920, keď bol kostol zatvorený. Koncom 90. rokov minulého storočia sa znovu objavila myšlienka otvorenia kostola v nemocnici. Od roku 2003 sa tu začalo s reštaurátorskými prácami. V súčasnosti do služby s radosťou prichádzajú veriaci z radov chorých a zdravotníckeho personálu.
Kostol sv. Sergeja Radonežského
Toto je najmladší z kostolov v Tomsku. Zakladateľom kostola je G. I. Trigorlov, riaditeľ závodu na impregnáciu pražcov. Keď videl jednu z kaplniek v Jaroslavli, bol tak potešený jej farbou, že sa pustil do stavby rovnakého kostola vo svojom rodnom meste. Podľa osobného projektu G. I. Trigorlova bol chrám postavený a vysvätený v roku 1997.
Katedrála Zjavenia Pána
Spočiatku, v roku 1630, to bol malý kostol Zjavenia Pána. Štatút katedrály získala oveľa neskôr. Drevený kostol často trpel požiarmi, no zakaždým ho obnovili. V roku 1777 bolo rozhodnuté postaviť na mieste starej drevenej budovy modernú kamennú stavbu. V 30. rokoch bol chrám zatvorený a v jeho múroch sa nachádzala továreň na topánky. V roku 1997 bola budova odovzdaná späť. Ruskej pravoslávnej cirkvi a začali práce na jej obnove.